История школы № 12 началась в послевоенное время: в 1949 году в Выборге открыли учебное заведение для начальных классов. Спустя три года школа была преобразована в восьмилетку. А в 1962-м получила статус средней общеобразовательной и переехала в новое здание. Уже несколько лет школа № 12 носит имя заслуженного учителя страны, участника Великой Отечественной войны Тимофея Кунаева, ушедшего из жизни в 2010 году.